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建PCR實驗室設(shè)所需資料

摘要:

近日,國家衛(wèi)健委舉辦全國視頻會議,明確提出“所有縣區(qū)級以上疾控機構(gòu)、二級以上綜合醫(yī)院要抓緊進行改造,在短時間內(nèi)形成核酸檢測能力”。你們醫(yī)院開始了嗎?


各地的公立機構(gòu)檢測能力不能滿足需求只是暫時的,獨立醫(yī)學(xué)實驗室在充實檢測力量的同時,發(fā)揮自己豐富的檢驗管理運營理念,以及區(qū)域化覆蓋的經(jīng)驗優(yōu)勢,融入到“國家隊”核酸檢測能力的建設(shè)中,順勢而為,乘勢而上。


二級醫(yī)院將面臨多種挑戰(zhàn)

開展病毒核酸聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)檢測,對檢測場地、實驗人員以及防護措施都有很高的要求。三級醫(yī)院都有PCR實驗室,達到新冠病毒核酸檢測條件并不難,而對于多數(shù)二級醫(yī)院來說,卻存在著諸多難點。

難點1

場地要求高

場地無疑是最大的難點之一。新冠病毒核酸檢測需要標準的四區(qū)分隔和氣流控制:試劑準備、標本制備、PCR擴增檢測和擴增產(chǎn)物檢測四個獨立的實驗區(qū)。每個獨立實驗區(qū)設(shè)置有緩沖區(qū),同時各區(qū)通過氣壓調(diào)節(jié),使整個PCR實驗過程中試劑和標本免受氣溶膠的污染并降低擴增產(chǎn)物對人員和環(huán)境的污染。機械連鎖不銹鋼傳遞窗保證試劑和標本在傳遞過程中不受污染(人物分流)。

難點2

人員要求高

進入PCR實驗室的檢驗工作者,需要經(jīng)過從基礎(chǔ)理論、實驗原理、規(guī)范操作、質(zhì)量保證到注意事項等規(guī)范的培訓(xùn),并獲取PCR上崗證。二級醫(yī)院人才相對短缺,操作經(jīng)驗欠缺,檢測準確性待確認,也需要投入更多人力資源。

難點3

檢測風險與防護高

檢測過程中,樣本的開蓋,核酸提取的震蕩、離心都有可能產(chǎn)生氣溶膠,有感染的風險,個人防護必須按照生物安全三級實驗室的個人防護要求進行。

難點4

經(jīng)費不足

二級醫(yī)院,經(jīng)費不多,對于建設(shè)PCR實驗室、購買大型的實驗設(shè)備較為吃力。

由此看來,二級醫(yī)院要逐步達到新冠病毒核酸檢測條件,確實存在著諸多難點……


隨著各地都在建立PCR實驗室,本文從硬件基礎(chǔ)的角度,梳理了PCR實驗室建設(shè)的幾個關(guān)鍵點,獨立醫(yī)學(xué)實驗室可以運用豐富的運營經(jīng)驗,進行建設(shè)指導(dǎo)、人員梯隊建立、質(zhì)控體系搭建、區(qū)域化服務(wù)支持等。

如何建設(shè)PCR實驗室


與PCR實驗室建設(shè)相關(guān)的指導(dǎo)文件主要有四份:

  • 《醫(yī)療機構(gòu)管理條例》符號列表

  • 《醫(yī)療機構(gòu)臨床實驗室管理辦法》

  • 《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》

  • 《臨床基因擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》

要求臨床PCR實驗室,不但在實驗室設(shè)置及儀器設(shè)備等硬件上要滿足開展臨床檢驗的條件,而且要求實驗室在日常工作要有文件化的工作程序。


下面就在PCR實驗室建設(shè)過程中的幾個關(guān)鍵控制點進行闡述:

01


建立PCR實驗室質(zhì)量管理體系

根據(jù)實驗室的具體情況編寫質(zhì)量體系文件,《質(zhì)量手冊》、《程序文件》、《作業(yè)指導(dǎo)書》,并保證管理體系運行有效。


管理體系的特點是應(yīng)有明確的目的、規(guī)范的管理、有效的制約、高效的機制、能自我發(fā)展的整體。


建立完善的SOP文件,對完成各項質(zhì)量活動的方法作出規(guī)定,每個SOP都應(yīng)對一個或一組相互關(guān)系的活動進行描述。


每個SOP文件應(yīng)說明該項質(zhì)量各環(huán)節(jié)的輸入、轉(zhuǎn)換和輸出所需的文件、物資、人員、記錄以及它們與有關(guān)活動的接口關(guān)系。


明確每個環(huán)節(jié)轉(zhuǎn)換過程中各項因素的要求,即由誰做、做什么、做到什么程序、達到什么要求,如何控制、形成什么記錄和報告,以及相應(yīng)的審批手續(xù)。


規(guī)定在質(zhì)量活動中需要注意的例外或特殊情況的糾正措施。SOP應(yīng)簡練、明確和易懂并且工作人員熟練掌握和嚴格遵守。

02


PCR實驗室的相關(guān)設(shè)置

要完成一組PCR實驗,通常需要經(jīng)過試劑配制、樣品處理、核酸擴增和產(chǎn)物分析4個實驗過程。


這4個實驗過程的實驗用房應(yīng)相鄰布置,組成一個獨立的PCR實驗區(qū)。標準的PCR實驗區(qū)包括:試劑準備區(qū)、標本制備區(qū)、擴增區(qū)、產(chǎn)物分析區(qū)、各區(qū)配套的緩沖區(qū)及公共走廊。

PCR實驗室整體平面布局




某醫(yī)院PCR實驗室平面布局如圖所示,整個區(qū)域有一個公用走廊,每個獨立實驗區(qū)設(shè)有專門的緩沖區(qū)。通過壓差控制,使整個PCR實驗過程中試劑和標本免受氣溶膠的污染,并且降低擴增產(chǎn)物對人員和環(huán)境的污染。

▲某醫(yī)院PCR實驗室平面圖

試劑準備區(qū)



該實驗區(qū)主要進行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝和主反應(yīng)混合液的制備。


試劑和用于標本制作的材料應(yīng)直接運送至該區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原材料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并在本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。


試劑準備區(qū)配備有2~8°C冰箱和-80°C冰箱,計算冷負荷時,需要將它們計算在內(nèi)。


房間的面積宜控制在15m2~20m2。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對正壓狀態(tài),以防止外界含核酸氣溶膠的空氣進入,造成污染。

標本制備區(qū)



該區(qū)域主要進行的操作為臨床標本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應(yīng)管和測定RNA時cDNA的合成。


標本制備區(qū)配備有2~8°C冰箱和-20°C冰箱,計算冷負荷時,需要將它們計算在內(nèi)。在標本制備區(qū),還需要配備生物安全柜,用于進行提取核酸的操作。


為避免提取的核酸在柜內(nèi)反復(fù)循環(huán),造成標本之間的交叉污染,出現(xiàn)假陽性結(jié)果,該區(qū)域配備的生物安全柜必須是B2型的。生物安全柜工作區(qū)垂直氣流全部來自實驗室,排風經(jīng)過高效過濾器過濾后直接排至室外,不允許回到安全柜和實驗室中。


根據(jù)經(jīng)驗,如果實驗室內(nèi)配備生物安全柜,每配備一臺,實驗室的面積增加10m2;標本制備區(qū)的面積宜在25m2~30m2之間。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為正壓,以避免從鄰近區(qū)進入本區(qū)的氣溶膠污染。

擴增室



該區(qū)域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增。此外,已制備的DNA模板和合成的cDNA(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應(yīng)混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應(yīng)混合液等也可在本區(qū)內(nèi)進行。


在巢式PCR測定中,通常在第一輪擴增后必須打開反應(yīng)管,因此巢式擴增有較高的污染危險性,第二次加樣必須在本區(qū)內(nèi)進行。


擴增室主要配備PCR實驗室的核心儀器PCR儀,本文實例中使用了ABI7500和ABI9700兩種PCR儀。


在實驗室建造過程中,需要給PCR儀配備專門的UPS電源,以保證其正常工作。該區(qū)面積控制在15m2~20m2。


本區(qū)的壓力梯度要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應(yīng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的不必要的走動。個別操作如加樣等應(yīng)在超凈臺內(nèi)進行。建議采用5~10Pa壓差,在控制上比較容易實現(xiàn)。

產(chǎn)物分析區(qū)



該區(qū)域主要進行的操作為擴增片段的測定。如使用全自動封閉分析儀器檢測,此區(qū)域可不設(shè)。


在室內(nèi)配備通風櫥,保證房間內(nèi)的相對負壓,空氣從室外流向室內(nèi)。該區(qū)面積控制在15m2~20m2。


本區(qū)是最主要的擴增產(chǎn)物污染來源,因此對本區(qū)的壓力梯度的要求為:相對于鄰近區(qū)域為負壓,以避免擴增產(chǎn)物從本區(qū)擴散至其它區(qū)域。建議采用5~10Pa壓差,在控制上比較容易實現(xiàn)。

03


正負壓區(qū)域緩沖室的設(shè)置

根據(jù)壓力梯度的要求,試劑配制室和樣品處理室為相對正壓,擴增室和產(chǎn)物分析室為相對負壓,要求正壓的區(qū)域和要求負壓的區(qū)域的緩沖室內(nèi)的壓力設(shè)計大不相同。


正壓緩沖室符合一般正壓潔凈室的緩沖原則,主要是防止室外環(huán)境空氣中的氣溶膠進入室內(nèi)。正壓緩沖室的布置如圖所示。

▲正壓緩沖室的布置圖

負壓緩沖室則是要求緩沖室對核酸擴增室及產(chǎn)物分析區(qū)保持正壓,對緩沖室外也保持正壓(主要是滿足室內(nèi)凈化需要,如室內(nèi)無潔凈要求,此處可以為0壓)。負壓緩沖室的布置如圖3所示。

▲負壓緩沖室的布置圖

04


污染的預(yù)防與控制

PCR實驗室設(shè)計的核心問題是如何避免污染。在實際工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標本間的污染。因此要避免污染,首先應(yīng)是預(yù)防,而不是排除。


工作區(qū)域的嚴格劃分,各個實驗區(qū)域要有明顯的標記(如醒目的門牌或不同的地面顏色等),以避免各個不同實驗區(qū)域設(shè)備物品、試劑等發(fā)生混淆。


合理的系統(tǒng)設(shè)置,合理的空調(diào)通風系統(tǒng)設(shè)置,盡量采用全送全排的空調(diào)系統(tǒng);嚴格的氣流壓力控制,保證不同的實驗區(qū)內(nèi)不同的壓力要求。


規(guī)范的操作,臨床基因擴增檢驗實驗室的技術(shù)人員必須進行上崗培訓(xùn),在實驗操作過程中,操作者必須戴手套,并經(jīng)常更換。清潔工作及時、正確。實驗工作結(jié)束后,必須立即對本區(qū)進行清潔。


嚴格的管理:嚴格控制進出實驗室的人員。在各個實驗區(qū)域使用帶有明顯區(qū)別標志的工作服(如不同顏色),當工作人員離開時不得將本區(qū)的工作服帶至其它區(qū)域;盡量減少在實驗區(qū)內(nèi)不必要的走動以減少交叉污染的可能性。擴增產(chǎn)物分析區(qū)是最主要的擴增產(chǎn)物污染來源,廢液不能在實驗室中傾倒,必須經(jīng)消毒液浸泡消毒后在遠離實驗室的地方棄掉,用過的吸頭等一次性材料也應(yīng)經(jīng)消毒液浸泡消毒后統(tǒng)一處理,如焚燒等;


總之,實驗室建設(shè)是一個復(fù)雜的問題,這里不討論人員的問題,實驗室人員的培養(yǎng)與沉淀,也需要一個過程,在建設(shè)的過程中要因地制宜,不要生搬硬套,結(jié)合自己的實際慢慢摸索出適合自己發(fā)展的建設(shè)思路。科學(xué)合理建設(shè)實驗室,更好的發(fā)揮實驗室的作用。


來源:檢驗醫(yī)學(xué)


-End-





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